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木薯比较基因组及光合产物高效积累机理研究取得突破

信息来源:热带生物技术研究所 | 作者:admin | 时间:2017-06-07 11:03

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近日,我所木薯研究团队首次解析了栽培木薯高生物积累和环境适应的主要进化途径,提出淀粉高效积累和糖运输模型,发展了新的基因组选择育种技术,为木薯和其它热带作物的基础研究和遗传改良开辟了新的途径和建立良好的基础。

该团队在国家重大基础研究973项目等基础上,通过基因组测序、转录组和其它现代生物学技术的应用,在六个方面取得重要突破。一是完成木薯野生祖先种W14和栽培品种KU50的全基因组测序,创建基因组序列草图,为全球木薯育种从表型选择走向基因组选择奠定基础。二是比较基因组研究揭示栽培木薯中特有基因和进化中高度选择的基因(3254个),涉及器官建成、环境刺激反应、催化活性、离子转运等9个重要的生物学过程。栽培木薯比野生种光合作用系统更强。三是提出木薯光合产物运输中蔗糖装载与卸载的模型。明确光合产物长距离运输的形式主要是蔗糖。四是提出木薯碳硫分配和淀粉高效积累的模式。栽培木薯在进化中形成较强的光合生产能力,以及较强的向块根贮藏库长距离运输的能力。块根中细胞壁代谢及其它次生代谢弱化,而蔗糖转运与淀粉合成通路显著强化,碳流分配走向淀粉高效积累。五是创建了一种扩增片断单核苷酸与甲基化多态性简化重测序方法(AFSM)。该方法能够到低成本、高通量对木薯和其它作物大群体的遗传多样性进行解析,为结合表型分析挖掘物种遗传变异的基因差异提供了有效的工具。六是创建国际木薯基因组数据库(www.cassava-genome.cn), 服务全球木薯研究。

该团队相关研究在Nature Communications、Nature Scientific Reports等学术期刊发表学术论文17篇,其中SCI收录6篇和中文核心期刊论文11篇,获授权国家发明专利1项,其中发表在《Nature Communications》上的“木薯基因组测序与注释”论文为木薯国际研究领域最具有影响力的文章之一,已经被下载100余次。AFSM专利技术已经应用于木薯、小桐子、甘蔗、橡胶树、胡椒和马铃薯等6种作物的群体重测序与GWAS研究,并且与种业研发公司达成合作开发意向,应用前景广阔。

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